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二代测序(NGS)*改变了人类肠道微生物群落的研究,即存在于人体肠道内的微生物群落(包括细菌、真菌和病毒)。虽然近年来,我们对人类微生物群落的了解有了很大的提高,但大多数研究都集中在细菌上,忽略了病毒基因组,故此现在对人类病毒组(人类微生物组的病毒成分)知之甚少,同时研究人类肠道病毒组的一个主要挑战是缺乏有效的高通量和可重复的病毒组分析方法。
科学家们利用qPCR和NGS对病毒组分析样品制备的不同步骤的效果进行了评估。利用一个模拟病毒组(包括9种高度多样化的病毒,其中包含冠状病毒)和一个细菌模拟菌群,进行均质、离心、过滤和随机扩增步骤的测试,由此建立了一种优化的粪便样品制备方法,即新型病毒富集技术NetoVIR。其中NetoVIR利用Minilys生物样品研磨器(法国Bertin)及Minilys提供的优化步骤对样品进行了高效、均匀地均质化,从而保证了进一步分析结果的可靠性和重复性。
下图所示,NetoVIR可以富集到模拟病毒组样本中存在的所有病毒。更多详情,请点击阅读原文。
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