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Precellys Evolution可靠无偏的微生物RNA研磨提取

发布时间:2020-11-09浏览:60次

 

人们越来越担心,科学界正在经历一场可重复性危机。微生物组学是目前面临最大挑战的领域之一,因为在其工作流程的每一步都会引入大量的偏差[1]。这令研究人员开始使用模拟微生物菌落标准(如Zymobiomics®微生物菌落标准(Zymo Research Corp.,Irvine,CA))来质疑和验证他们的方法。Zymobiomics®标准包含10种特性良好的微生物(即5种革兰氏阳性、3种革兰氏阴性和2种酵母),它们以规定的比例混合。该标准由不同大小和细胞壁韧性的微生物组成,是评估微生物工作流程每一步的理想标准。

 

研究显示,在核酸提取步骤中选择的细胞裂解技术可显著影响微生物组二代测序(NGS)的分析结果[2]。珠式机械裂解已成为金标准。由于其强大的3D运动,Precellys Evolution在几秒钟内提供了强大的裂解功能。在这里,我们使用ZymoBIOMICS®微生物菌落标准来证明Precellys®Evolution生物样品研磨器与Zymobiomics®DNA/RNA Miniprep试剂盒相结合能够在不损害RNA完整性的情况下实现完全溶解,从而实现准确的亚基因组和微生物组分析。此外,我们还评估了用此工作流程从本标准中提取的核酸的质量,以及另外3个样本,包括革兰氏阳性菌和革兰氏阴性菌以及人类粪便样本。

 

Precellys生物样品研磨器:

超快速: up to 10 000 rpm

超灵活: 0.5, 2, 7和 15mL研磨管

超高效: 强力3D振动

超保护: Cryolys Evolution新型冷却技术,无需液氮和压缩空气

 

参考资料

1、Wesolowska-Andersen A, Bahl Ml, Carvalho V et al. Choice of bacterial DNA extraction method from fecal material influences community structure as evaluated by metagenomic analysis. Microbiome 2(1), 19 (2014)

2、Costea Pl. Zeller G, Sunagawa S et al. Towards standards for human fecal sample processing in metagenomic studies. Nat. Biotechnol. 35(11), 1069-1076 (2017)

3、Zymo Research is a privately-held American manufacturer of molecular biology research tools used for DNA and RNA research and analysis. Their offices are headquartered at 17062 Murphy Ave., Irvine, CA92614, Tel:949-679-1190

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